通过GDCRNATools下载TCGA数据的时报错怎么办 - 大数据

博主：xiaoweixiaowei 2023-01-18 条评论

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TCGA 数据下载

通过GDCRNATools下载TCGA数据的时候出现了以下的报错：

gdc-client软件安装和配置

  1. 下载软件地址：https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool，根据自己的操作系统下载对应的版本，这里下载Mac版本。

    通过GDCRNATools下载TCGA数据的时报错怎么办 - 大数据

  3. 将下载的软件解压，并放在一个自己好找的目录，例如我放在了Documents/TCGA数据下载中

 

下载数据

  1. 在GDC官网：https://portal.gdc.cancer.gov 中找到自己所需要的数据，比如HNSC的miRNA数据。然后下载Manifest到刚刚软件放置的目录
  2. 先点击Exploration，然后在左侧选取需要的癌症类型和项目，选好后点击View Files in Repository
然后就会跳转到Repository页面，可以在这里进一步筛选所需要的数据。选择好之后点击Add All Files to Cart， 然后可以在右上角的cart中看到添加了多少个文件。如果不要下载其他的数据了，就可以直接点击Manifest，下载到Documents/TCGA数据下载中。

然后打开终端，在终端输入
    ./gdc-client download -m gdc_manifest.2020-08-11.txt -d ./HNSC/ 就开始下载啦~

到此，关于“通过GDCRNATools下载TCGA数据的时报错怎么办”的学习就结束了，希望能够解决大家的疑惑。理论与实践的搭配能更好的帮助大家学习，快去试试吧！若想继续学习更多相关知识，请继续关注云网站，小编会继续努力为大家带来更多实用的文章！

The End

发布于：2023-01-18，除非注明，否则均为 主机评测原创文章，转载请注明出处。

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